Fille de l'économiste et philosophe Georges Zourabichvili, issu de la famille géorgienne Zourabichvili (qui avait sombré dans une grande pauvreté après la révolution russe1 et qui avait émigré vers la France), et de Nathalie von Pelken, d'origine germano-russe2, Hélène Zourabichvili naît le 6 juillet 1929 dans le 16e arrondissement de Paris3. Elle a un frère, Nicolas. Elle est par ailleurs la cousine de Salomé Zourabichvili, fille de son oncle Lévan et 5e présidente de la Géorgie.