Buyoya épouse une Tutsie, originaire d'une famille de négociants, Sophie Ntaraka. 

Pierre Buyoya, En 1967, il est admis à l'École royale des cadets de Bruxelles, en Belgique. Il déclare à ce propos : « pour moi, l'armée était l'unique échelle sociale. » Il reste en Belgique jusqu'en 1975 et passera par l'École royale militaire (1970 à 1974) et l'École d'application des troupes blindées.