Le nom de Marie Arena est évoqué dans cette affaire du Qatargate depuis le début en raison des liens d'amitié entre l'eurodéputée socialiste et Pier Antonio Panzeri, le principal inculpé dans ce dossier de corruption présumée au Parlement européen. Cependant, jusqu'à présent, le travail des enquêteurs n'a pas établi de preuve de l'implication de Marie Arena dans ce dossier du Qatargate. Pier Antonio Panzeri, repenti, a par ailleurs toujours blanchi l'eurodéputée.