Il a de nouveau des ennuis judiciaires en octobre 1961, lorsqu'il invite une jeune apache de 14 ans, qu'il a rencontrée à Mexico, pour la faire travailler dans son club de nuit (le « Berry's Club Bandstand ») à Saint Louis. Après l'arrestation de la jeune fille pour prostitution (elle-même aurait fait croire à Berry qu'elle était majeure, c'est-à-dire qu'elle avait 21 ans), Chuck Berry est accusé d'avoir transporté une mineure entre deux États pour l'exploiter. Berry est condamné à 20 mois de prison ferme et doit verser une amende de 5 000 dollars. Il est libéré fin 1963

Willy Aubert