Clervoy participe à la mission STS-84. 

STS-84 (15 au 24 mai 1997) est la sixième mission de rendez-vous et d'amarrage de la Navette spatiale à la station russe Mir. J.F. Clervoy est nommé commandant de la charge utile. Un grand nombre de tâches cruciales lui sont confiées dont la surveillance des systèmes de la Navette pendant les phases d'approche et d'amarrage, et la gestion du module SpaceHab abritant plus de 20 expériences scientifiques et quatre tonnes de matériel de ravitaillement de la station Mir. Pour cette mission, il est aussi préparé aux sorties dans le vide. Il passe 221 heures et 20 minutes en vol et réalise 144 orbit

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